巡航导弹也叫飞航式导弹，你可以把他看作无人机，使用涡扇涡喷发动姬，在大气层内飞行，速度相对较慢，一般是亚音速飞行，飞行高度较低，为了躲避雷达一般会从多山的的地界穿过，当然也可以进行隐身处理，降低发现概率。制导方式一般是组合制导，初段一般是惯导，中段地形匹配制导或者，末段可以GPS制导，主动雷达寻旳制导激光制导或者前两者组合起来，我说的制导方式也不全，应该有更多选择！命中精度较高，一般能到10米以内，射程相对较短，2000公里已经很远了！

弹道导弹你可以看做成卫星，只不过轨道与地面有交点而已，使用火箭发动机，弹道相对固定，是椭圆轨道的一部分，初段由火箭推动出大气层，中段在大气层外按卫星轨道那种方式运行，末段进入大气层，速度很快，基本都能超过十几倍音速，只有上升段有推力，中段和末段都是无推力飞行，当然会有调姿的小喷管进行姿态调整，到这个对速度已经影响不大了，一般采用天文制导和惯性制导，命中精度较高相对较低！但是近些年随着反导的压力，弹道导弹也不是最原始的纯弹道式了，末段会进行一些机动，以躲避敌方的拦截！制导方式也有很大改进，不单纯才用惯性制导，也会采用GPS制导和末段主动雷达寻旳制导，命中精度较高能达到几十米，不然怎么打航母？！

二者的更大区别主要是在于航程，巡航导弹一般射程在两千千米之内，而弹道导弹射程往往是在五千千米以上，甚至超过一万千米。同时，前者的用途是用于常规战争中，伊拉克战争，阿富汗战争中均有巡航导弹的出没，而弹道导弹主要是战略威慑作用，这是两者之间的最主要区别。